創立沿革
本所創立於2001年，當時由一群醫界、學界、產業界的專業人士，因感于社會文明雖然進步，但生活品質卻日益下滑；
各式文明怪病（如愛滋病、狂牛症、禽流感等）倡狂爆發，以致人心惶惶，除正統醫療途徑外，大眾追求千奇百怪的偏
方與補品，然而坊間充斥各式各樣的保健食品，品質卻良莠不齊；因此一群熱心人士有錢出錢、有力出力，在大家共同努力下蕈研所終於誕生了。
成立宗旨
本所成立的宗旨是希望能在菇蕈、生菌的領域內專業研發、改良出最好的菌種，除了可提供農民種出最好的農產品外，最主要的是希望能將蕈菌萃取及加工技術提升，將來能提供醫界、生醫工程最好的材料。除了可提升國人生活品質外，也希望健康、美麗、長壽都能讓每人夢想成真！
本所性質：
1.本所為永久性質之農業財團法人。
2.本所證照字號為：農糧字第900172501號。
3.主管單位為行政院農業部農糧署。
業務項目
1.推動臺灣地區蕈菌產業相關基礎研究，提升臺灣成為國際蕈菌研究重鎮。
2.開發、創新蕈菌產品及加工處理技術，協助特殊蕈菌產品研發成果之技術，促進高附加價值產業發展事項。
3.協助規劃蕈菌產業產銷計畫與市場策略，發展蕈菌產業成為臺灣生物科技代表產業事項。
4.籌劃專業蕈菌研究期刊、雜誌、網站，提供蕈菌產業資訊及市場動態。
5.舉辦蕈菌農業講座、會議或研討會，推廣與教育蕈菌文化事項。
6.配合學術或文化團體廣宣蕈菌文化與應用價值事項。
7.搜集、分析及整合全球各地區蕈菌產業資訊，提供交流合作與技術協助。
8.規劃蕈菌產業資訊工程發展計畫，建立臺灣地區蕈菌產業資訊系統事項。
業界合作事項
1.技術移轉
2.菌種鑒定與蕈菌生技相關諮詢
3.生技產業開發、媒合委託服務
4.微生物發酵之技術諮詢與整廠規劃
2024～2026工作計畫
1.鷹架（Scaffold）菇菌凝膠材料之評估
2.教學工廠規劃與設置
3.建立生技媒合平臺與技轉專案規劃
財團法人中華民國蕈菌生物科技研究所捐助章程
第 一 條 本所依照民法暨農業財團法人監督準則組織之，定名為「財團法人中華民國蕈菌生物科技研究所」（以下簡稱本所）。
第 二 條 本所以推動台灣地區蕈菌農業研究、扶持蕈菌產業發展為設立目的，依有關法令規定辦 理下列業務：
ㄧ、推動台灣地區蕈菌產業相關基礎研究，提升台灣成為國際蕈菌研究重鎮。
二、開發、創新蕈菌產品及加工處理技術，協助特殊蕈菌產品研發成果之技術，促進高附加價值產業發展事項。
三、協助規劃蕈菌產業產銷計畫與市場策略，發展蕈菌產業成為台灣生物科技代表產業事項。
四、籌劃專業蕈菌研究期刊、雜誌、網站，提供蕈菌產業資訊及市場動態。
五、舉辦蕈菌農業講座、會議或研討會，推廣與教育蕈菌文化事項。
六、配合學術或文化團體廣宣蕈菌文化與應用價值事項。
七、蒐集、分析及整合全球各地區蕈菌產業資訊，提供交流合作與技術協助。
八、規劃蕈菌產業資訊工程發展計畫，建立台灣地區蕈菌產業資訊系統事項。中華民國九十年五月八日會議決議
